2021年10月，中共中央、国务院印发《黄河流域生态保护和高质量发展规划纲要》。我校积极响应黄河战略的号召，率先组建了校长负责、院士领衔，以城乡规划、环境科学等优势学科为主干，多学科交叉协同的黄河战略研究院，打造创新型智库研究机构。校长于德湖教授任研究院院长，副校长邱立平教授任执行院长，日本工程院院士陈飞勇教授、建筑城规教授崔东旭教授兼任研究院首席科学家。黄河研究院以决策咨询、创新理论、集成技术为宗旨，集聚高层次人才团队，深入开展黄河流域生态系统服务、城市群高质量发展、“四水四定”、黄河文化等研究。

2023年7月，经中共山东省委机构编制委员会批复，同意我校设立科研机构 “黄河流域生态保护与城乡高质量发展研究中心”（简称“中心”），成为省内服务黄河战略唯一高校内设科研机构。中心下设生态保护与低碳、黄河流域“四水四定”、城市群协同发展、数字黄河CIM技术、黄河文化和遗产保护五个研究所。中心拥有黄河流域国土空间生态修复山东省工程研究中心、山东省高等学校服务黄河流域生态保护和高质量发展协同创新中心、山东省城乡空间智能规划高校重点实验室等科研平台。中心研制的黄河流域城市群高质量发展指数，被山东省推进黄河流域生态保护和高质量发展办公室纳入《山东省落实黄河重大国家战略集成改革行动方案》；承担“黄河流域‘四水四定’与城乡高质量发展关键技术研究与示范”是省高校一类特色项目；获批第一批山东省自然资源厅科技创新团队；被黄河流域大学联盟推举为城乡规划领域副主任委员单位。

在省发展改革委黄河战略处推动下，中心与山东省港口集团、中建山东投资公司、山东省城乡规划设计研究院、水发集团共同组建“山东省黄河流域创新发展有限公司”，聚焦深化服务黄河国家战略需求，打造沿黄流域首个“战略谋划+项目规划+投资建设+运营管理”全链条市场化技术服务平台，积极推动科技创新、产教融合和赋能新质生产力，努力为实施黄河重大国家战略贡献建大力量。